Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPS29Q9UBQ0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPS29Q9UBQ0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms