Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms