Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CHPF2Q9P2E5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CHPF2Q9P2E5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms