Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CCDC180Q9P1Z9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CCDC180Q9P1Z9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms