Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ASF1BQ9NVP2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms