Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PARVAQ9NVD7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms