Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCC13Q9NSE7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms