Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KRT82Q9NSB4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms