Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS2Q9NRF8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms