Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSPNQ9HAW4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSPNQ9HAW4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms