Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FKRPQ9H9S5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms