Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRCIN1Q9C0H9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRCIN1Q9C0H9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms