Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AMBRA1Q9C0C7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms