Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABARAPL3Q9BY60 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms