Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CACNG6Q9BXT2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms