Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-6Q9BXR3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-6Q9BXR3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms