Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
LIMD2Q9BT23 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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