Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOXF2Q9BQY4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOXF2Q9BQY4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms