Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GPA33Q99795 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GPA33Q99795 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms