Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHP1Q99653 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms