Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NAP1L3Q99457 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms