Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CRBNQ96SW2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms