Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF354BQ96LW1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF354BQ96LW1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms