Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SGF29Q96ES7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms