Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAF2Q96CS3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FAF2Q96CS3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms