Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf44Q96CB5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms