Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFT1Q96AA3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms