Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPTSSAQ969W0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTSSAQ969W0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms