Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC35B4Q969S0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms