Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HGDQ93099 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HGDQ93099 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HGDQ93099 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HGDQ93099 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HGDQ93099 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HGDQ93099 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HGDQ93099 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HGDQ93099 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HGDQ93099 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HGDQ93099 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HGDQ93099 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HGDQ93099 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HGDQ93099 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HGDQ93099 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HGDQ93099 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HGDQ93099 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HGDQ93099 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HGDQ93099 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HGDQ93099 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HGDQ93099 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms