Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms