Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRUQ92729 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms