Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOBEC4Q8WW27 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOBEC4Q8WW27 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms