Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS1

CLDND2, Claudin domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND2Q8NHS1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDND2Q8NHS1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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