Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MYRIPQ8NFW9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MYRIPQ8NFW9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms