Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BEST4Q8NFU0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BEST4Q8NFU0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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BEST4Q8NFU0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BEST4Q8NFU0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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