Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FUNDC1Q8IVP5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms