Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKAP1Q86WV1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKAP1Q86WV1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms