Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLNKQ7Z7G1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms