Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms