Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms