Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM5Q71RC9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms