Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP31Q70CQ4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP31Q70CQ4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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