Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFPL4BQ6ZWI9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms