Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETMD1Q6P1Q0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms