Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RWDD4Q6NW29 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms