Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATG16L1Q676U5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms