Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EEF1DP3Q658K8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EEF1DP3Q658K8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EEF1DP3Q658K8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EEF1DP3Q658K8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EEF1DP3Q658K8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EEF1DP3Q658K8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EEF1DP3Q658K8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms