Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCID2Q5JVF3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms