Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LACTB2Q53H82 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms